Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Zfp616J3QN14 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms