Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
E030018B13RikJ3QMS9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms