Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp408H7BX78 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Zfp408H7BX78 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp408H7BX78 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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