Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nccrp1G3X9C2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nccrp1G3X9C2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nccrp1G3X9C2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nccrp1G3X9C2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms