Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gnl3l-202ENSMUST00000112691 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms