Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5861F6VCN9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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