Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf212F6TQD1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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