Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc146E9Q9F7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc146E9Q9F7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc146E9Q9F7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc146E9Q9F7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc146E9Q9F7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc146E9Q9F7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms