Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc85cE9Q6B2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms