Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20425E9Q035 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms