Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsph10bE9PYQ0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph10bE9PYQ0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms