Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc8E9PWG2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms