Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3298E9PW80 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3298E9PW80 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms