Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms