Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgfbr3lD3YZZ2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms