Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samd1D3YXK1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms