Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clip3B9EHT4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Clip3B9EHT4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms