Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Phf11bB4XVQ1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Phf11bB4XVQ1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf11bB4XVQ1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf11bB4XVQ1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf11bB4XVQ1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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