Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprbB2RU80 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms