Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Col4a6B1AVK5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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