Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atp8b5A3FIN4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atp8b5A3FIN4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp8b5A3FIN4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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