Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2al1jA2BFR3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms