Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Samt1A2BED8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms