Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabreA2AMW3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms