Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Prdm12A2AJ77 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms