Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmpd4A2AFR3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms