Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Col9a3A2ACT7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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