Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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