Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm3550W4VSN7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm3550W4VSN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms