Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms