Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn8Q9Z260 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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