Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RfxankQ9Z205 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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RfxankQ9Z205 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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RfxankQ9Z205 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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RfxankQ9Z205 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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RfxankQ9Z205 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RfxankQ9Z205 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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