Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms