Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CcsQ9WU84 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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