Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Psmb3Q9R1P1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms