Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamc3Q9R0B6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamc3Q9R0B6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms