Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmfrQ9R049 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AmfrQ9R049 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AmfrQ9R049 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms