Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ubxn8Q9QZ49 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms