Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Six6Q9QZ28 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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