Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Limd1Q9QXD8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Limd1Q9QXD8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Limd1Q9QXD8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms