Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfrsf19Q9JLL3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tnfrsf19Q9JLL3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms