Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cabp1Q9JLK7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms