Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg3Q9JL95 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg3Q9JL95 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg3Q9JL95 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg3Q9JL95 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prg3Q9JL95 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prg3Q9JL95 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms