Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl39Q9JKF7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms