Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pgpep1Q9ESW8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms