Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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