Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms