Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clstn1Q9EPL2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms