Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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MNCb-2875Q9DCB3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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