Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syde1Q9DBZ9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms